Desde el punto de vista constructivo estamos ante una obra básicamente gótica, en piedra, con arcos apuntados y bóvedas de crucería sucintamente estrelladas que arrancan de pilastras con múltiples baquetones y adornos. El templo, que se terminó en 1495, Se construyó en varias etapas por los que el proyecto inicial fue modificado en varias ocasiones. En un primer momento la nave central estaba coronada por una austera bóveda cuyo último pilar, que corresponde al crucero, fortalecía el punto de apoyo del cimborrio formando un grueso contrafuerte. Pero en 1484 el proyecto primitivo fue remodelado por la mano de Guas que trasformó la cabecera en una capilla funeraria revestida por un cimborrio, pensada para los enterramientos de los Reyes Católicos aunque no se llegó a realizar.